41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2895 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  98.23 
 
 		 339 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  44.29 
 
 		 324 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  41.8 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  28.15 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  27.06 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  38.04 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  42.19 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  31.15 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  30.61 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  31.15 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  30.61 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  28.85 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  43.09 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  37.86 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  37.86 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  31.49 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  26.45 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  42.24 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  42.24 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  32.2 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1052 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  43.51 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  36.7 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  41.3 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  32.88 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  38.71 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1043 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  37.63 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1010 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1007 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  30.22 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1040 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  37.39 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  27.17 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  35 
 
 		 274 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  34.17 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1067 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3211  hypothetical protein  27.59 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  31.36 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>