13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0870 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  48.3 
 
 
1043 aa  938    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  100 
 
 
1040 aa  2086    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  52.99 
 
 
1052 aa  1075    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  45.33 
 
 
1007 aa  878    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  48.51 
 
 
1067 aa  937    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  74.22 
 
 
1010 aa  1507    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  23.05 
 
 
339 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  22.34 
 
 
339 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  20.54 
 
 
328 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  25.62 
 
 
208 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  22.94 
 
 
324 aa  51.6  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  26.8 
 
 
233 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  26.83 
 
 
211 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>