36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4817 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  61.35 
 
 
211 aa  242  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  60.39 
 
 
211 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3211  hypothetical protein  53.02 
 
 
210 aa  191  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  29.44 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  37.61 
 
 
339 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  34.71 
 
 
339 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  32.2 
 
 
304 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  30.69 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  28 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  28 
 
 
251 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  43.52 
 
 
360 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  30 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.06 
 
 
304 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  33.64 
 
 
307 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  30.83 
 
 
303 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  39.66 
 
 
324 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  30.83 
 
 
303 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  34.55 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  25.62 
 
 
1040 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  32.43 
 
 
308 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  34.95 
 
 
300 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  36.29 
 
 
294 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  23.39 
 
 
1052 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  34.17 
 
 
328 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  33.08 
 
 
324 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  33.08 
 
 
324 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  22.58 
 
 
1067 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  20.75 
 
 
1043 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  29.5 
 
 
369 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  24.79 
 
 
1010 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  21.77 
 
 
1007 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  28.38 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  31.82 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  31.82 
 
 
303 aa  41.2  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>