20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3826 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  95.62 
 
 		 274 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  31.56 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  33.77 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  28.92 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  33.52 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  29.87 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  28.69 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  29.07 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  35 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  28.68 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  34.17 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  34.17 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  39.32 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  30.6 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  29.69 
 
 		 324 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  21.4 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  36.92 
 
 		 356 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  28.26 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>