36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1898 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  50 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  42.72 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  48.29 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  41.99 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  44.6 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  42.8 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  36.23 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  33.9 
 
 		 217 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  29.17 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  28.35 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  30.15 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  27.56 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  39.85 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  38.26 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  37.39 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  38.35 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  38.35 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  29.72 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  37.59 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  42.98 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  42.11 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  35.86 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  36.28 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  27.31 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  26.4 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  39.1 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  39.1 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  28.35 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  31.07 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  32.71 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  31.78 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>