34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3591 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  40.52 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  39.58 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  36.88 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  32.63 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  35.86 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  32.42 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  31.92 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  33.93 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  32.13 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  32.59 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  37.3 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  36.21 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  26.1 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  36.23 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  36.23 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  28.78 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  35.29 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  42.24 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  42.24 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  26.18 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  25.3 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  28.77 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  28.52 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  28.52 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  25.3 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  33.07 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  37.93 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  37.93 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  24.59 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  23.51 
 
 		 360 aa  52.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  32.71 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  25.45 
 
 		 369 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>