39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4457 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  82.72 
 
 
303 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  75.81 
 
 
303 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  75.81 
 
 
303 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  74.55 
 
 
304 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  83.39 
 
 
303 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  83.06 
 
 
303 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  75.09 
 
 
300 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  58.99 
 
 
324 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  58.63 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  50 
 
 
304 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  53.31 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  49.48 
 
 
304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  45.23 
 
 
308 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  31.42 
 
 
339 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  31.02 
 
 
339 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  37.81 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  31.88 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  28.39 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  36.41 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  32.06 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  31.68 
 
 
211 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  27.84 
 
 
360 aa  62.4  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  33.64 
 
 
208 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  31.37 
 
 
244 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  31.58 
 
 
306 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  30.77 
 
 
251 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  36.15 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  29.81 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  28.89 
 
 
211 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  27.39 
 
 
217 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  27.87 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  28.11 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  26.57 
 
 
1052 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  32.62 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  29.06 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  25.14 
 
 
1043 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  30.09 
 
 
274 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>