40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1885 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  60.26 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  60.26 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  52.26 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  51.92 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  50.17 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  55.35 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  54.39 
 
 		 303 aa  261  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  52.8 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  49.04 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  53.31 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  53.31 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  55.04 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  55.04 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  46.73 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  34.34 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  34.04 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  33.93 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  29.78 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  29.18 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  28.09 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  26.54 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  29.38 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  29.65 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  24.44 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  33.62 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  31.39 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  32.74 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  31.86 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  29.32 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  30.6 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1043 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  30.88 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3211  hypothetical protein  28.37 
 
 		 210 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  24.07 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  36.36 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  28.68 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1007 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1052 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>