29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0116 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  26.45 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  26.45 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  29.12 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  25.36 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  29.12 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  42.7 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  23.8 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  28.48 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  24.06 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  24.01 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  38.98 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  39.13 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  23.91 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  39.13 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  38.04 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  28.38 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  33.83 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  34.29 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  34.29 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  33.9 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  33.9 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  31.11 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  24.92 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  32.58 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  29.81 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  29.52 
 
 		 211 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>