36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2422 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  100 
 
 
304 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  89.8 
 
 
303 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  89.47 
 
 
303 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  68.79 
 
 
303 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  70.65 
 
 
300 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  74.55 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  74.55 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  69.02 
 
 
303 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  68.35 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  55.76 
 
 
324 aa  242  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  55.76 
 
 
324 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  47.69 
 
 
304 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  50.17 
 
 
323 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  43.6 
 
 
304 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  41.94 
 
 
308 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  29.22 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  28.85 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  33.45 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  30.16 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  30.29 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  36.84 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  34.12 
 
 
369 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  30.86 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  32.12 
 
 
208 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  29.78 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  30.82 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  35.85 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  35.58 
 
 
244 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  34.91 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  25.36 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  28.26 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  29.75 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  30.53 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  32.38 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  24.15 
 
 
217 aa  45.8  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  38.02 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>