40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0396 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  99.34 
 
 		 303 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  90.76 
 
 		 303 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  71.24 
 
 		 303 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  71.24 
 
 		 303 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  83.06 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  83.06 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  68.35 
 
 		 304 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  73.54 
 
 		 300 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  56.43 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  56.43 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  49.08 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  53.82 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  47.65 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  45.58 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  32.81 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  33.12 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  34.29 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  32.37 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  28.99 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  35.45 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  30.43 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  32.73 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  29.37 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  29.79 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  30.29 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  36.48 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  31.77 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  31.82 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  32.99 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  31.96 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  26.21 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  31.58 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  32.09 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  30.91 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1052 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1043 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1010 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>