29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2985 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  543  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  95.62 
 
 		 274 aa  472  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  31.15 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  30.4 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  32.77 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  34.66 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  31.75 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  31.2 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  29.96 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  29.79 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  35 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  35 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  33.8 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  30.07 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  28.7 
 
 		 324 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  30.08 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  35.04 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  28.06 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  35.04 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  35.38 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  20.66 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  33.86 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  29.06 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  27.35 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  29.06 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  28.07 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  33.86 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  28.1 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>