31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  697    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  37.31 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  27.06 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  27.06 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  31.72 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  40.13 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  37.72 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  37.72 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  36.18 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  34.12 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  26.74 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  30.36 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  30.36 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  31.82 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  23.75 
 
 		 321 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  38.18 
 
 		 244 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  35.38 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  39.2 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  42.16 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  34.68 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  41.18 
 
 		 251 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  28.83 
 
 		 211 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  27 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  29.5 
 
 		 208 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1052 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  30.43 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  25 
 
 		 7659 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1040 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.185589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>