38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2494 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  584  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  99.67 
 
 		 303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  89.47 
 
 		 304 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  71.91 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  75.81 
 
 		 307 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  75.81 
 
 		 307 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  71.74 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  71.91 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  71.24 
 
 		 303 aa  305  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  57.61 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  57.61 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  47.57 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  51.92 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  45.29 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  41.42 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  32.21 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  30.31 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  34.74 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  31.77 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  39.13 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  31.17 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  28.24 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  31.25 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  30.15 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  38.38 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  38.1 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  26.07 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  28 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  37.14 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  29.25 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  29.75 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  32.01 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  27.64 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  35.54 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  33.86 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>