36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1218 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  709    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  37.31 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  28.15 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  28.27 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  30.53 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  29.22 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  34.39 
 
 		 233 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  38.51 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  35.29 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  35.66 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  33.78 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  34.09 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  34.09 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  32.88 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  42.73 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  24.08 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  34.42 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  29.88 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  30.87 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  34.42 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  34.9 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  34.9 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  22.88 
 
 		 274 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  25.3 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  37.17 
 
 		 211 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  32.17 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  22.51 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  35.15 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  28.93 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  33.67 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1067 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  33.67 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  32.65 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3211  hypothetical protein  36.11 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1010 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  34.72 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>