45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0213 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  634    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  98.76 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  57.61 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  57.61 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  55.76 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  60.26 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  57.86 
 
 		 300 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  56.49 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  58.99 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  58.99 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  46.75 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  56.25 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  55.56 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  43.88 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  31.7 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  31.31 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  31.19 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  31.7 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  36.97 
 
 		 233 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  25.23 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  32.95 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  31.32 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  32.03 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  33.08 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  34.42 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  32.04 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  42.11 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  35.04 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  32.29 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  35.03 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  31.25 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  27.65 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  40.7 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  36.52 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  30.66 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  30.18 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  26.76 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  39.81 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1043 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1007 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1040 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1010 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>