47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5683 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  62.83 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  52 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  49.64 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  46.75 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  46.75 
 
 		 324 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  49.33 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  44.95 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  43.6 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  45.68 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  48.41 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  49.48 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  49.48 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  47.65 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  47.65 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  33.76 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  33.76 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  31.3 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  39.64 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  32.1 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  26.64 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  32.43 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  32.67 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  31.76 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  32.43 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1043 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  39.32 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  34.07 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  27.09 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  32.02 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  32.58 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  27.33 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  28.84 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1010 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  31.94 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1069  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1052 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1753  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1007 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.428284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  24.26 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4184  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1067 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.485228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  25.78 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1040 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  28.94 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  27.91 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>