30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1263 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  82.07 
 
 
251 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  82.47 
 
 
251 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  35.29 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  35.29 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  35.56 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  35.07 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  32.04 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  26.37 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  38.84 
 
 
369 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.91 
 
 
303 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  30.43 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  36.78 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.33 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  34.96 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  33.85 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  34.96 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  30.83 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  30.83 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  30.56 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3211  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  35 
 
 
328 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  32.04 
 
 
324 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  32.04 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  29.91 
 
 
324 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  34.41 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  39.13 
 
 
321 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  32.17 
 
 
303 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  32.17 
 
 
303 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>