39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4301 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  63.61 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  41.47 
 
 		 356 aa  195  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  41.74 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  47.95 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  46.89 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  46.18 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  39.93 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  38.32 
 
 		 217 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  31.68 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  31.36 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  33.05 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  32.97 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  32.36 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  30.43 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  30.31 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  28.48 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  29.37 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  34.46 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  34.46 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  32.39 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  27.8 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  33.59 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  32.06 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  25.67 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  30.94 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  25.74 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  33.14 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  32.58 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  35.11 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  35.11 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  23.45 
 
 		 369 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  33.03 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4778  hypothetical protein  26.7 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  36.47 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  32.11 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  33.03 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  28.32 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>