22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2215 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  40.81 
 
 		 298 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  32.39 
 
 		 356 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  40.1 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  36.15 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  34.48 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  33.73 
 
 		 342 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  30.4 
 
 		 284 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  30.57 
 
 		 294 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  34.66 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  31.36 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  33.52 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  27.17 
 
 		 339 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4778  hypothetical protein  34 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  27.17 
 
 		 339 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  25.32 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  25.32 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1885  hypothetical protein  26.92 
 
 		 323 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  24.15 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  27.38 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  24.36 
 
 		 304 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  23.92 
 
 		 328 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>