14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9024 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9024    100 
 
 		 411 bp  815    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227662  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4497    86.09 
 
 		 471 bp  295  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  85.51 
 
 		 831 bp  280  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4922    88.98 
 
 		 551 bp  133  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.835991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  81.3 
 
 		 828 bp  61.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2457    86.44 
 
 		 204 bp  54  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  90.48 
 
 		 978 bp  52  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  91.89 
 
 		 918 bp  50.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  90.24 
 
 		 1111 bp  50.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  90.24 
 
 		 1111 bp  50.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 789 bp  48.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 789 bp  48.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 789 bp  48.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 789 bp  48.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>