11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4497 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  99.57 
 
 		 831 bp  898    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4497    100 
 
 		 471 bp  934    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9024    86.09 
 
 		 411 bp  295  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2457    88.67 
 
 		 204 bp  163  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4922    86.49 
 
 		 551 bp  135  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.835991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  85.71 
 
 		 828 bp  101  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  92.31 
 
 		 918 bp  54  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  80.51 
 
 		 711 bp  52  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  88.89 
 
 		 978 bp  50.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  90.24 
 
 		 1111 bp  50.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  90.24 
 
 		 1111 bp  50.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>