8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4922 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4922    100 
 
 		 551 bp  1092    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.835991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  79.71 
 
 		 831 bp  139  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4497    86.49 
 
 		 471 bp  135  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9024    88.98 
 
 		 411 bp  133  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227662  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4499  integrase, catalytic region  91.53 
 
 		 402 bp  77.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4964    92 
 
 		 357 bp  67.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.920763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  92.68 
 
 		 828 bp  58  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  85.25 
 
 		 831 bp  50.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>