More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4499 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4499  integrase, catalytic region  100 
 
 
133 aa  270  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  100 
 
 
276 aa  254  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  69.11 
 
 
275 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  68.29 
 
 
276 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 
275 aa  170  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 
275 aa  170  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 
275 aa  170  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 
275 aa  170  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  58.54 
 
 
276 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  58.54 
 
 
239 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  50.81 
 
 
275 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  51.61 
 
 
236 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  48.39 
 
 
293 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  50.81 
 
 
296 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  50.81 
 
 
296 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  48.72 
 
 
290 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  50.81 
 
 
296 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  43.44 
 
 
290 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  43.44 
 
 
290 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  48 
 
 
279 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  48 
 
 
279 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  47.2 
 
 
279 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  50.4 
 
 
305 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  46.4 
 
 
276 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  46.83 
 
 
279 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  42.74 
 
 
295 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  51.96 
 
 
278 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  56.47 
 
 
245 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  44 
 
 
306 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  44 
 
 
258 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  51.28 
 
 
275 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  51.28 
 
 
275 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  43.2 
 
 
307 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  43.2 
 
 
307 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  43.2 
 
 
306 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  43.2 
 
 
306 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  43.61 
 
 
278 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  45.38 
 
 
307 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  45.38 
 
 
288 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  45.38 
 
 
308 aa  103  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  45.38 
 
 
308 aa  103  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  45.38 
 
 
308 aa  103  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  43.2 
 
 
308 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  50 
 
 
257 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 
280 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 
262 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 
262 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 
262 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  56.98 
 
 
262 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  39.32 
 
 
369 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  39.32 
 
 
369 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0743  integrase, catalytic region  40.32 
 
 
172 aa  97.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  51.22 
 
 
233 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  51.22 
 
 
191 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  51.22 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  51.22 
 
 
208 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  51.22 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 
325 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0077  hypothetical protein  35.77 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.115939  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
390 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  37.01 
 
 
382 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>