More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9134 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9134  transposase  100 
 
 		 385 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  90.39 
 
 		 385 aa  713    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  33.53 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  33.53 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  33.53 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  33.53 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  33.53 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  33.53 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4668  hypothetical protein  77.91 
 
 		 130 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4172  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.63 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1064  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.18 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4722  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.18 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2552  putative IS1492 transposase, TnpA1  30.65 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.9 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0864  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1662  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.12 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1289  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.12 
 
 		 347 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0961  ISGsu4, transposase  30.35 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2599  ISGsu4, transposase  30.35 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.1 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0538  putative transposase  28.24 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0532  putative transposase  27.25 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00618  ISGsu4, transposase  29.22 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6214  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.67 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05219  hypothetical protein  28.2 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01926  hypothetical protein  28.2 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02006  hypothetical protein  28.2 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1385  putative transposase or inactivated derivative  27.95 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08192  transposase  27.91 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  27.99 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.99 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.99 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000103198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.99 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1202  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.99 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.100953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.81 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0442  transposase  33 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145361  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.55 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.76 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  26.63 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0279  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.456081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0859  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2600  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.9 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3855  haem catalase/peroxidase  25.85 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4384  transposase IS116/IS110/IS902  26.85 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2346  arginyl-tRNA synthetase, class Ic  25.85 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3077  response regulator receiver domain-containing protein  25.85 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  27.15 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.85 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1833  Heme exporter protein CcmA  25.51 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3462  ISGsu4, transposase  25.51 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0104746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  25.69 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  25.69 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  29 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3529  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.92 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.38 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2599  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.92 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.1 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 		 542 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.65 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8273  transposase  33.52 
 
 		 186 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.75 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.75 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  27.17 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  31.01 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.52 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.93 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5379  putative transposase for insertion sequence element  33.7 
 
 		 208 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.5 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  26.01 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.54 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1224  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.36 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3442  transposase IS116/IS110/IS902  26.59 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.36 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0676  transposase IS116/IS110/IS902  26.59 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.36 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1260  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.36 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2031  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.65 
 
 		 343 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>