15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9009 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9009  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148116  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4817  hypothetical protein  77.57 
 
 		 321 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7276  hypothetical protein  76.66 
 
 		 317 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4799  hypothetical protein  45.54 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4196  hypothetical protein  38.62 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.276849  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4549  hypothetical protein  36.64 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419514  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4575  hypothetical protein  33.53 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4582  hypothetical protein  36.75 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4233  hypothetical protein  37.02 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.727595 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3752  hypothetical protein  33.55 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4028  hypothetical protein  33.55 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4359  hypothetical protein  64.71 
 
 		 89 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00335359  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2841  hypothetical protein  31.16 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3403  hypothetical protein  31.6 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4510  hypothetical protein  34.04 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>