17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9093 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3406  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0689  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9093  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313804  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7046  transposase  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0651  hypothetical protein  86.49 
 
 		 74 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2764  hypothetical protein  68 
 
 		 76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563488  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4000  hypothetical protein  67.57 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1790  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  63.16 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.896296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3515  hypothetical protein  60.27 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780841  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4100  hypothetical protein  54.05 
 
 		 77 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3984  ISPpu13, transposase Orf3  55.56 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3115  ISPpu13, transposase Orf3  55.56 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.542239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2155  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  56.76 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0962171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3434  hypothetical protein  58.11 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4505  ISPpu13, transposase Orf3  41.67 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0199  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1013  hypothetical protein  56.25 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000332135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>