123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9047 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  100 
 
 		 171 aa  350  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 133 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  45.21 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  41.1 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  43.42 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  46.05 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  39.02 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  45.71 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  41.79 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 123 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  43.66 
 
 		 125 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  47.14 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  39.74 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  56.9 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  40.85 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  37.66 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  46.55 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  38.16 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.05 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.11 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  37.31 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  32.84 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  38.81 
 
 		 127 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  43.48 
 
 		 533 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 124 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  43.48 
 
 		 533 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  37.14 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  34.67 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 711 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  36.84 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 696 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  33.33 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 686 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 936 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  41.3 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  29.11 
 
 		 507 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  39.13 
 
 		 531 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 128 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  28.77 
 
 		 580 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  31.88 
 
 		 120 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  41.3 
 
 		 541 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 1036 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.13 
 
 		 541 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.13 
 
 		 541 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 198 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  27.4 
 
 		 685 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 822 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  36.11 
 
 		 571 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.78 
 
 		 695 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 531 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 683 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 807 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  29.55 
 
 		 573 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 695 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 673 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 506 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 681 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  28.36 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 681 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>