More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0691 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  256  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  82.03 
 
 		 128 aa  215  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  79.69 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  79.69 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  80 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  75.41 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  52.38 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  48.82 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  47.58 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  51.35 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  53.92 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  40.34 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  39.32 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  40.35 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  47.86 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  40 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  39.45 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 151 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  37.72 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  38.32 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  53.25 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  50 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  37.72 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  39.25 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 662 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  37.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  38 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 688 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 695 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 695 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  39.64 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 696 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.66 
 
 		 497 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3896  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1036 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 707 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  35 
 
 		 685 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 704 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 705 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  36.79 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 686 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3743  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 811 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  33.62 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  35 
 
 		 580 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  37.07 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1013 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 702 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4264  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.471811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>