More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3741 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  62.6 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  66.37 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  61.06 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  51.33 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  54.63 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  58.26 
 
 		 125 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  49.11 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  47.27 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  53.15 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  54.81 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  48.8 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  53 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  49.57 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  44.25 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  52.88 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  43.86 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  46.43 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  47.12 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  46.43 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  45.38 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 182 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  43.36 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 688 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  41.38 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 695 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  36.75 
 
 		 695 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 696 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  35.71 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  47.62 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  44.74 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 618 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  39.47 
 
 		 539 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  42.16 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 651 aa  73.9  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 936 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 650 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 196 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 743 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  41.9 
 
 		 541 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  35.96 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 		 534 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1036 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  32.74 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  34.45 
 
 		 534 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  36.52 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 766 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 655 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  39.09 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 704 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  38.18 
 
 		 533 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  37.27 
 
 		 531 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39.82 
 
 		 529 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.05 
 
 		 541 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.05 
 
 		 541 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 508 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>