More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2320 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  40.68 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  45.13 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  42.99 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 124 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  42.86 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  41.38 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  37.93 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  42.57 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 618 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 809 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 589 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  34.31 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  36.54 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 529 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 673 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  37.96 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 743 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  35.54 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  35.59 
 
 		 695 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 727 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1076 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  35.29 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  37.59 
 
 		 812 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1011 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 926 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 943 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  40.87 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 727 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 966 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 727 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 741 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 905 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  33.9 
 
 		 695 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.7 
 
 		 1036 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1053 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  40 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 740 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 939 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  37 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  37.74 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 655 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  39 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  33.59 
 
 		 538 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  33.6 
 
 		 538 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  39.45 
 
 		 829 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 688 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  33.9 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 853 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 941 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 810 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>