More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3551 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  39.42 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  37.5 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  37 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  38.68 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 905 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  38 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1028  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 870 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  35 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1651 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 807 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.37 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 758 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1646 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.2 
 
 		 1036 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 966 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  32.67 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.76 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  31.43 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1036 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 851 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1631 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  32.56 
 
 		 573 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  35.71 
 
 		 756 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 851 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 851 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1067 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 789 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 789 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  39.05 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  33.01 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 		 611 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 		 611 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.96 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 		 611 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 611 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 		 611 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  34.26 
 
 		 538 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  33.33 
 
 		 559 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  34 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 588 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131409  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 740 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 703 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 815 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 		 611 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.12 
 
 		 1960 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 725 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 781 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 741 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 470 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 943 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 789 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 553 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 845 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 936 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  34.26 
 
 		 538 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  31.2 
 
 		 949 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 949 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 887 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.48 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 830 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 553 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  34.85 
 
 		 1987 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 473 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 		 1643 aa  58.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 673 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>