More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1668 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  76.99 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  70.59 
 
 		 124 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  70.94 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  53.45 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  56.48 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  59.05 
 
 		 126 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  55.66 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  53.98 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  50 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  52.34 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  54.87 
 
 		 126 aa  119  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  51.82 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  55.08 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  55.08 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  54.29 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  53.77 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  56.6 
 
 		 129 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  54.46 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  47.79 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  49.19 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  49.19 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  53.4 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  53.98 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  54.29 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  49.52 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  41.59 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  44.14 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  38.6 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  40.68 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  51.22 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 696 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  37.07 
 
 		 695 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 695 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  40 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 688 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  34.78 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 705 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  42.16 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  46.15 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  42.55 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 936 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 859 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 704 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  37.5 
 
 		 845 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 707 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  35.9 
 
 		 695 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 1036 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 695 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  37.61 
 
 		 507 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  36.72 
 
 		 945 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  36.72 
 
 		 945 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  36.36 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.59 
 
 		 949 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 949 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 699 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 702 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 548 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 905 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 589 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>