146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0314 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  42.98 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  37.72 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  38.18 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  35.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.55 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  35.45 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  30.7 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  34.17 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  31.36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  33.06 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  27.42 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  24.56 
 
 		 1005 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  29.69 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  28.57 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 707 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 161 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  22.88 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  38.81 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 496 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2995  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 173 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  22.03 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  30.63 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  31.73 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  31.48 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 696 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 704 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 		 695 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  26.55 
 
 		 695 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 702 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  23.08 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 559 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2184  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 497 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.682977  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  28.92 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 717 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 641 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 702 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 457 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2568  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  29.82 
 
 		 541 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  29.82 
 
 		 541 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  27.35 
 
 		 396 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 		 681 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  29.82 
 
 		 541 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 120 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 675 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 717 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>