More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2557 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  100 
 
 		 194 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  99.42 
 
 		 173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  93.64 
 
 		 173 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  67.2 
 
 		 198 aa  222  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  43.35 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  57.89 
 
 		 130 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 128 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 124 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 130 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  51.28 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 129 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  46.09 
 
 		 134 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 134 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 129 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  40.2 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  39.25 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 129 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.84 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  41.03 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  38.33 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  41.59 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 696 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  42.22 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  36.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  37.84 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  38.24 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  35.85 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  38 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 128 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  31.03 
 
 		 695 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 695 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  39 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 688 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 705 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 707 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  36 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  34.71 
 
 		 1005 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  33.02 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  37.8 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 732 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  29.73 
 
 		 123 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  29.66 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 698 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  34.31 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 817 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 781 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1021 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 741 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 662 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 630 aa  54.7  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  34.34 
 
 		 544 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1444  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 459 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  32.2 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 702 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  40.7 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 796 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>