More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1503 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  254  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  83.08 
 
 		 129 aa  206  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  64.41 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  59.2 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  58.4 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  56.64 
 
 		 198 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  57.02 
 
 		 196 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  52.34 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  53.97 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  53.04 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 173 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  42.86 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  39.67 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  32.54 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  36.11 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  39.17 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  34.65 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  32.73 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  27.83 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 696 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1067 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  37.08 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  28.85 
 
 		 695 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 695 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  30.36 
 
 		 396 aa  57.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 655 aa  57  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.81 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  32.73 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  30.39 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  30.39 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  29 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1646 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1018 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 1415 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  27.78 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  37.23 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  27.78 
 
 		 531 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  27.78 
 
 		 533 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  31 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  26.98 
 
 		 533 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.32 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 766 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 770 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  31.43 
 
 		 479 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 741 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 882 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 680 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 793 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1444  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 459 aa  50.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 727 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 209 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 887 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 630 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>