More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4537 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  100 
 
 
125 aa  246  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  59.26 
 
 
124 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  62.26 
 
 
124 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  59.26 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  54.78 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  53.78 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  55.26 
 
 
130 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  53.98 
 
 
131 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  52.17 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  49.09 
 
 
123 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  52.17 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  49.57 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  47.37 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  49.09 
 
 
124 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  50.45 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  49.21 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  50.46 
 
 
126 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  54.31 
 
 
125 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  49.15 
 
 
127 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
128 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  44.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  46.9 
 
 
122 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  48.18 
 
 
126 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  48.6 
 
 
131 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  47.79 
 
 
122 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  52.25 
 
 
129 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  48.08 
 
 
133 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  48.15 
 
 
127 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  42.28 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  47.32 
 
 
115 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  40.65 
 
 
128 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  44.26 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  48.51 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  50 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  50 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  47.37 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  43.55 
 
 
123 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  43.52 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  47.47 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
135 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  39.52 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  41.07 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  41.12 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  41.12 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  41.12 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  43.27 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
695 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.82 
 
 
695 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  42.16 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  40.95 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  37.74 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
696 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
688 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
136 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  36.27 
 
 
196 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  38.24 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  43.66 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  37.14 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  38.68 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  45.87 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  40.96 
 
 
847 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1067 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
943 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
573 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  44.05 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  32.17 
 
 
692 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
1036 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
807 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
651 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
492 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
686 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
705 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  39.47 
 
 
845 aa  67.4  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  31.9 
 
 
673 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
711 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  37.37 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
695 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
916 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  30.43 
 
 
537 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  35.58 
 
 
573 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
618 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
754 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  36.27 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
588 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1095 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
589 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
589 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1050 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
548 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
721 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>