More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7092 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  81.36 
 
 		 177 aa  277  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  47.43 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 173 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  43.35 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  64.29 
 
 		 130 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  58.26 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  57.02 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  57.14 
 
 		 129 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 129 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 129 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 129 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 134 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  42.98 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 151 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  42.16 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  40.83 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  40.16 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.52 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  33.6 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  40.71 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  39.22 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  32.5 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 125 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 688 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.3 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 696 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 761 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1067 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 926 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 743 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 655 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1415 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1036 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1105 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 840 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  40.45 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  33.03 
 
 		 695 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 650 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 793 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  35 
 
 		 936 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  35.29 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 695 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 859 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  33.6 
 
 		 754 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 789 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 926 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 727 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  34.58 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  30.83 
 
 		 594 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 734 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  37.63 
 
 		 1427 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  31.82 
 
 		 541 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 702 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 751 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  31.82 
 
 		 541 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 589 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2995  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 926 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  27.59 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  31.25 
 
 		 866 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 673 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 741 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  43.28 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 853 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>