More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1228 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  65.32 
 
 		 124 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  68.7 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  61.06 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  62.26 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  57.14 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  47.5 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  51.33 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 131 aa  119  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  54.29 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  55.56 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  55.56 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  44.54 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  53.4 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  51.89 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  48.18 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 128 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  53.47 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  44.83 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 182 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  40 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  53.4 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  53.4 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  43.36 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 132 aa  95.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  45 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  42.11 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  38.14 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  53.09 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 696 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 695 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.78 
 
 		 695 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 688 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  34.48 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  42.86 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  38.52 
 
 		 529 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  37.5 
 
 		 573 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1036 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 618 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 548 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.35 
 
 		 497 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  37.39 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 705 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  35.4 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  36.21 
 
 		 507 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 766 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  42.31 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 754 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  33.62 
 
 		 949 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1018 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 949 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 673 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 589 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>