More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4814 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  81.1 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  80.87 
 
 		 115 aa  190  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  49.21 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  46.03 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  44.44 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  47.75 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  48.25 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  40.8 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  43.36 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  45.37 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.46 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  38.98 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  37.93 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 688 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  36.36 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  37.07 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  35.83 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1036 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1039 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1034 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  38.4 
 
 		 701 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  40.22 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 696 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 558 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 701 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 673 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 864 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 490 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  30.65 
 
 		 622 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 807 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 695 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  32.79 
 
 		 695 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 822 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 618 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 589 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1067 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  36.51 
 
 		 1299 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 628 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 703 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.4 
 
 		 1036 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 926 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1651 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 810 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  31.36 
 
 		 761 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 754 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 711 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  33.33 
 
 		 558 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  29.27 
 
 		 1427 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 732 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  33.64 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  32.77 
 
 		 845 aa  61.6  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 943 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 622 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 1164 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>