More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0850 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  255  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  54.63 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  48.78 
 
 		 124 aa  119  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  52.88 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  48.82 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  54.21 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  54.29 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  54.21 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  51.28 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  56 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  48.03 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  48.03 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  47.24 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  47.58 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  48.82 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  55.14 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  46.23 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  48.6 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  45.63 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  51.38 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  44.34 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  45.6 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  45 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  50 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  46.6 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  44.58 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  53.49 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  40.35 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  43.65 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  44.66 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 688 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  43.43 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  41.58 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  46.46 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  43.69 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  32.76 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 695 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  34.75 
 
 		 695 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  46.15 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  42.86 
 
 		 194 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 173 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  36.89 
 
 		 847 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1067 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 702 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 573 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0711  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 692 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 662 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 772 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  38.26 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  39.2 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 696 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  31.71 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 699 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1039 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  33.33 
 
 		 507 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>