More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5535 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  65.04 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  65.04 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  64.41 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  61.79 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  64.29 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  61.06 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  57.89 
 
 		 194 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  56.9 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  56.45 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  60.17 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  47.22 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  41.6 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  40.8 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  42.06 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  45.54 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  40.18 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  42.86 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  33.05 
 
 		 695 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  44 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 695 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 696 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 688 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 		 1076 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  32.03 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 		 1067 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  36.08 
 
 		 685 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  37.96 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 520 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  34.26 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  37 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1018 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1053 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  36.17 
 
 		 580 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2991  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  39.81 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 783 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  39.05 
 
 		 783 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.41 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  43.33 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1014 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1105 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  31.3 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 887 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 741 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 492 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  34.59 
 
 		 754 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 584 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4845  response regulator receiver  33.64 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  30.23 
 
 		 533 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  39.29 
 
 		 280 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  31.45 
 
 		 533 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 673 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 		 916 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  40.45 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 743 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  40.74 
 
 		 936 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  38.46 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 589 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>