239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4092 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  100 
 
 		 161 aa  316  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  39.25 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  39.82 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  39.62 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  37.07 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.52 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  39 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  39 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.89 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  36.45 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 125 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  35.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 943 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  35.09 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  42 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0711  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 966 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  30.08 
 
 		 580 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  38.32 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  29.77 
 
 		 685 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 686 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.94 
 
 		 1036 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  39.53 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  35.29 
 
 		 531 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 696 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 688 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 905 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 551 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  32.26 
 
 		 573 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 548 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  29 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  30.09 
 
 		 701 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 120 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  31.48 
 
 		 858 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  31.5 
 
 		 134 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 1646 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 660 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 662 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1105 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1013 aa  50.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  34.19 
 
 		 539 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 927 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 1426 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1651 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 822 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  35 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 887 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 701 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 		 695 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 936 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  29.66 
 
 		 845 aa  49.7  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 732 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 795 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  25.23 
 
 		 695 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 821 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  24.81 
 
 		 497 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 688 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 926 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>