More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4593 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  256  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  83.72 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  83.72 
 
 		 128 aa  204  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  61.34 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  60.17 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  58.68 
 
 		 126 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  53.6 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  59.68 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  55.36 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  59.65 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  56.6 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  55.14 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  52.68 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  55.45 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  45.05 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  51.35 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.75 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  47.75 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  41.82 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  51.06 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  41.07 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  40.91 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  52.81 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  46.85 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  39.29 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  42.48 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 688 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 1036 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0073  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  35 
 
 		 695 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  41.07 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 695 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  37.72 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7092  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.08524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0091  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.589534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1226  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915128  normal  0.471544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 696 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  43.62 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 743 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 702 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 1018 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 		 673 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  37.29 
 
 		 534 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  38.26 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  39.06 
 
 		 673 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 741 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.4 
 
 		 916 aa  67  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  35.71 
 
 		 685 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9047  chemotaxis response regulator  57.14 
 
 		 171 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0295266  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  40 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  34.48 
 
 		 580 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  35.94 
 
 		 756 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  34.96 
 
 		 1427 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 942 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 740 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2001  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 727 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3762  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0711  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>