More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2071 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0314  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  46.23 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  48 
 
 		 124 aa  96.7  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  43.12 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.94 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  40.37 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  34.75 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  40.87 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.67 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  38.79 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  35.71 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 732 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  31.82 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1036 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 589 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 589 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  32.43 
 
 		 695 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  34.78 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 695 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  27.64 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  28.32 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 696 aa  57  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 721 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  37.29 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  29.46 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 707 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 699 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  27.87 
 
 		 692 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 660 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 611 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  38.66 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  38.66 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  30.83 
 
 		 573 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 611 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 611 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 734 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 611 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 611 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 611 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 758 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 640 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  38.46 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 705 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 943 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  26.96 
 
 		 1005 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 548 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  26.23 
 
 		 537 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 754 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 851 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  30.97 
 
 		 507 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  29.57 
 
 		 851 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  37.29 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  29.57 
 
 		 851 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>