More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0906 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3331  response regulator receiver protein  55 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  40.18 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  36.52 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  40.54 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  35.4 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  40.87 
 
 		 396 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  34.51 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 660 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 793 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2568  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 752 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1631 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  30.7 
 
 		 845 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  30.09 
 
 		 507 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 732 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  32.48 
 
 		 685 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1036 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 905 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2105  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 727 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 695 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  33.64 
 
 		 1164 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1164 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  38.53 
 
 		 538 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 783 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  28.7 
 
 		 580 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  36.54 
 
 		 559 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 727 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 727 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0074  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.675697  hitchhiker  0.00113108 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  35.09 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  29.41 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2939  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  31.62 
 
 		 539 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  34.21 
 
 		 903 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 809 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4799  hypothetical protein  35.48 
 
 		 867 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.04 
 
 		 1036 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 662 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  29.82 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1106 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 906 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 903 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 823 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 728 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 839 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  32.74 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  30.43 
 
 		 829 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  33.33 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 707 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 853 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 1299 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 743 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 925 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  32.77 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 925 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.59 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 244 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  32 
 
 		 182 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>