More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2939 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2939  response regulator receiver protein  100 
 
 
286 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31125  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
727 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
727 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
840 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
727 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
732 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
642 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.5 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1014 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3260  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
880 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
760 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
742 aa  69.7  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
803 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
857 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  33.62 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3061  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.48 
 
 
450 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.35 
 
 
829 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3285  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
793 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
838 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1011 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
874 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
766 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  37.7 
 
 
1561 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
762 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
128 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0291  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.58 
 
 
470 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4689  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 
447 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1222 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0255  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 
226 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3302  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.75 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.334689  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
785 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1232  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
578 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.416855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
642 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
888 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
660 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
853 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
926 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
811 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  31.97 
 
 
824 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
508 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
946 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.35 
 
 
484 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.09 
 
 
469 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.09 
 
 
469 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
126 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4272  two-component response regulator  34.35 
 
 
470 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1193 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.43 
 
 
844 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3179  DNA-binding response regulator VicR  27.78 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0879082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 
123 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.67 
 
 
454 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
864 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
143 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
121 aa  64.7  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
822 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
540 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 
459 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
135 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
803 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
853 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
958 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7053  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00262574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
897 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
650 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1415 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  31.45 
 
 
749 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 
126 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 
456 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 
456 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1108 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  32.79 
 
 
892 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
747 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5543  two component transcriptional regulator, Fis family  35.65 
 
 
180 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
837 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.62 
 
 
491 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1113 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 
185 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  32.74 
 
 
185 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  30 
 
 
1427 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
1059 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  32.74 
 
 
185 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.9 
 
 
466 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 
444 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
358 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
630 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 
444 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
839 aa  62.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
132 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 
707 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
943 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 
733 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  35.96 
 
 
783 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>