More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4740 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5929  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.75 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5650  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.64647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  47 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  46 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  40.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  32.17 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  42 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.07 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  36.94 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  38.83 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  38 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  42.57 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  35.34 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  36.52 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4626  two-component regulatory system sensor kinase  38.26 
 
 		 983 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  40.2 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  35.48 
 
 		 632 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  35.48 
 
 		 632 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  34.82 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6212  response regulator receiver protein  42.57 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392664  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 673 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  34.17 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  34.68 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1735  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  33.87 
 
 		 692 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 703 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2939  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 286 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.84 
 
 		 1036 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  30.51 
 
 		 847 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 685 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  33.64 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  36 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  36.59 
 
 		 646 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 707 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 708 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 754 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 		 646 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  32.46 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 446 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 772 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  31.82 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 		 699 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  33.61 
 
 		 676 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 831 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 457 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 589 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  42 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 662 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 936 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 927 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  30 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>