More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3474 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  256  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  97.66 
 
 		 128 aa  253  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  79.69 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  75.83 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  48.03 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  48.76 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  49.57 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  49.19 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  53.92 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  48.18 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 124 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  53.27 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0775  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0313977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  45.13 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3963  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.150847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0851  response regulator receiver  42.15 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0810  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.316292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3607  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0864  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00632773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.24 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2945  response regulator receiver domain-containing protein  39.64 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161273  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2499  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4112  response regulator receiver  45.76 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576276  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4480  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.361856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1195  Two component sensor kinase/response regulator hybrid protein  39.66 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4593  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  39.29 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0771  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0328  response regulator receiver  37.39 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0634669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2510  response regulator receiver  41.18 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3969  response regulator  40.35 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0144  hypothetical protein  46.32 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2794  response regulator receiver protein  48.04 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2989  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  38.74 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  42.34 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  46.88 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5396  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5790  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889979  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5228  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0214459  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3551  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  35.04 
 
 		 695 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3529  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 695 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4092  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3896  hypothetical protein  39.81 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5645  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 182 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 662 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 688 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6937  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0671376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7425  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  41.44 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4264  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.471811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 696 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.86 
 
 		 497 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1503  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2939  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4367  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.711428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0675  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 705 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2488  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365206  normal  0.13004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4072  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3778  response regulator receiver  38.05 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0998176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5535  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  decreased coverage  0.00892468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  36.36 
 
 		 685 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4034  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 707 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5605  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  36.36 
 
 		 580 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 793 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 686 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 704 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2071  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  35.85 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2310  sigma-54 dependent response regulator  40 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 943 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1013 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1719  flagellar regulatory protein C  40.91 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0473988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>