More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1391 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  91.11 
 
 		 135 aa  238  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  63.24 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  62.77 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  59.57 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  59.57 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  42.98 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0143  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363881  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4740  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9028  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.59 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 803 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0850  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.886181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  39.09 
 
 		 490 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 807 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  39.13 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0497  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 702 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0906  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39.09 
 
 		 529 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0691  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.852187  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4041  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0979956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4537  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  41.9 
 
 		 396 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4814  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24379  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  40.95 
 
 		 544 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  30 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  38.89 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  44.44 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 743 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 858 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 741 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0614  putative GAF sensor protein  41.03 
 
 		 622 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00376401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  40.95 
 
 		 1036 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 957 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 618 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  33.09 
 
 		 534 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  34.71 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 793 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  46.34 
 
 		 847 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4845  response regulator receiver  39.82 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 754 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 650 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  36.44 
 
 		 539 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5391  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3346  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 1328 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.61 
 
 		 989 aa  63.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 673 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2650  response regulator receiver domain-containing protein  40.45 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1895  response regulator receiver  42.57 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  36.04 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3474  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3150  response regulator receiver  36.11 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 810 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1076 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  41.98 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  41.46 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 622 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 		 740 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  35.14 
 
 		 533 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 695 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 761 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 727 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 926 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 727 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 661 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5313  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3331  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 936 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 653 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 766 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1036 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>